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- 抗ウイルス療法は、ALT(GPT)値がALT(GPT)≧30IU/Lの場合に考慮する。
しかし、高齢者やHBe抗原陰性例、抗ウイルス剤の治療が難しい例では肝庇護療法（SNMC（強力ネオミノファーゲンC注）、UDCA（ウルソサン内服）等）で経過をみることも可能である。
- 若年（35歳未満）症例では、インターフェロン（IFN）長期注射治療（3ヶ月以上）あるいはEntecavir（バラクルード）内服が原則。
尚、ステロイド、IFN、核酸アナログの短期併用治療を考慮すること。
ただし組織像の軽い症例では自然経過でのHBe抗原のseroconversionを期待し経過観察することもある。
（IFN在宅自己注射可能な症例はQOL（生活の質）を考慮して在宅自己注射を推奨する。）
- 中高年（35歳以上）症例では、核酸アナログ未使用症例は、Entecavir（バラクルード）が第一選択薬になる。
- 母子感染例はIFN抵抗性のことが多く、Entecavir（バラクルード）単独あるいはEntecavir（バラクルード）＋IFN連続療法も適応になる。
- Lamivudine（ゼフィックス）耐性ウイルスによる肝炎に対しては、Adefovir（ヘプセラ）が第一選択になる。
組織学的進行例ではHBV DNA量が上昇した時点でAdefovir（ヘプセラ）を開始する。
- 肝硬変例および肝細胞癌治癒後の症例も、核酸アナログの治療を行う。
